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サイサチサイサチ機器カタログで新たに掲載をスタートしたＡＳＴＲＩＤＥ社【Basepair】のご案内です
ノーコードで使えるNGSデータ解析プラットフォーム｜Basepair
Basepairについて
Basepairは、ベンチサイエンティストからバイオインフォマティシャンまで使えるクラウドNGSデータ解析プラットフォームです。
生データをアップロードして解析メニューを選択するだけのNGS（次世代シーケンサー）データ解析です。fastqなどがあれば、RNA-SeqでのDEGやシングルセルRNA-Seqのクラスター解析まで一気に完了します。インタラクティブなプロットやテーブルを使って、遺伝子の絞り込みも可能。解析結果は、PNG、SVGやCSVでダウンロード可能。
RNA-Seq、シングルセルRNA-SeqやChIP-Seq、ATAC-Seq、WGS、WESなど主要なアプリケーションに対応しています。
APIも用意し、コマンドラインからのバッチ処理にも対応していますので、大量サンプルの処理でもサーバーの準備は不要です。
生成できるプロットの一例
